Natürlich ist es unwahrscheinlich, daß man sich einen Virus oder einen Trojaner über die Paketverwaltung isnstalliert!
Es ist zum einen viel unwahrscheinlicher als bei Windows, da es für Linux kaum Viren und Trojaner gibt!! Zum anderen ist das Paketrepository schon mit Sicherheitsmechanismen geschützt und es kann eben NICHT jeder mal eben was dort hochladen.
Die Infos, die hier stehen sind teilweise echt haarsträubend. Ich nutze Linux seit 2007 auf dem Destop mit 3 Rechnern und ohne Virenschutz. Ab und zu hab ich mal einen installiert und geschaut. Ich hatte noch NIE irgendeinen Virus oder ähnliches. Linux auf dem Desktop ist mit Garantie momentan das sicherste Betriebssystem, das Du bekommst.